在污水處理領域，液體菌種發揮好的作用。在生物發酵罐中通過深層培養生產出的液體形態微生物菌種，能夠降解有機污染物，降低化學需氧量（COD）和生化需氧量（BOD），從而改善水質，減少環境污染。液體菌種在成本方面為固體的三十分之一，降低了污水處理成本。縮短了時間成本，提高了處理能力。

    1.液體菌種使菌體細胞生長繁殖快速：在液體環境中，營養物質均勻分布，為菌體細胞提供足夠養分，使生長速度加快，能在短時間內增殖。例如，在適宜條件下，數小時內就能實現數量的增長，提高了處理污水的速度。菌體細胞生長速度快，適應污水環境快，處理系統的啟動時間和調試周期減少。

    2.液體菌種可以通過篩選和馴化，適應不同類型的污水，對于生活污水和工業廢水等都能應對自如。對于含有高濃度有機物、重金屬、有毒有害物質等復雜成分的工業廢水，液體菌種也能逐漸適應并進行處理。此外，液體菌種能夠在不同的溫度、pH值、溶解氧等環境條件下生長和發揮作用，具有很強的環境適應性。一些耐鹽、耐酸、耐堿的液體菌種，在惡劣的污水環境中也能生存并處理污染物，這樣擴大了其應用范圍。

    3.液體菌種具有很好的代謝活性，能夠很快降解污水中的有機污染物，如化學需氧量（COD）、生化需氧量（BOD）等。通過菌體的呼吸作用、分解作用等，將有機物質轉化為無害的二氧化碳、水和微生物細胞物質，從而達到凈化污水的目的。在氮、磷等營養元素的去除方面也有好的反應，例如通過硝化、反硝化等作用，將污水中的氨氮轉化為氮氣，將磷元素吸收并轉化為微生物體內的物質，降低污水中的氮、磷含量，防止水體富營養化。

    4.安全性高：液體菌種處理污水是一種生物處理方法，不會產生二次污染，對環境友好。它避免了使用化學藥劑可能帶來的環境污染和對生態系統的破壞。而且經過篩選和馴化的液體菌種對人體和其他生物的安全性高，不會對生態環境和人類健康造成潛在威脅。

    5.液體菌種在城市生活污水處理中被應用于活性污泥法。在活性污泥法中，液體菌種能夠降解有機污染物，減少廢水中的氨氮和亞硝酸鹽含量。通過向污水中投加液體菌種，其中的微生物如細菌、真菌、原生動物等能夠快速繁殖和代謝，消耗污水中的有機污染物。細菌是活性污泥中的主體，能穩定水中的有機物質，形成絮凝體并構成菌膠團，具有強的吸附和分解有機物的能力。真菌則能分解難降解有機物質，原生動物以細菌和其他微生物為食，促進廢水中懸浮物的沉降，有利于活性污泥的穩定化。